Flotillens opgaver bliver løst af medlemmer, der har forskellige forudsætninger med hensyn til kompetencer, alder, aktivitetsniveau og krav til fysiks udfoldelse.
Som medlem er man sammen med 8-15 andre i en besætning eller gruppe, der sammen med 2-4 andre besætninger eller grupper indgår i en division på ca. 30-50 frivillige medlemmer.
Flotillen er organiseret med et Stabselement og to divisioner, som beskrevet herunder:
Stabselementet
Består af flotillechefen, næstkommanderende/planlægningsofficer, 3.kommanderende/uddannelses-støtteofficer og operationsofficeren.
Stabselementet har ansvar for daglig ledelse og støtte til flotillen. - Stabselementets aktivitetniveau varierer fra højt til middel, alt efter funktionen.
Kommandodivisionen
Beatår af: Divisionstroppen hvor Kommando-logistikofficeren og Kommandobefalingsmanden hører hjemme. Af Informations- og uddannelsesstøttesektionen der består af Rekrutteringsofficer, Kontaktofficer, Historiker, Skydelærer, IT-befalingsmand, Webmaster og Sundheds- og træningsvejleder. Af Fartøjssektionen der består af Fartøjsmester og Fartøjsmesterassistent. Og af Forsynings- og vedligeholdelsessektionen bestående af Forsyningsbefalingsmand og Næstkommanderende
SØ divisionen
Består af sejlende besætninger sammensat af: Fartøjsfører, Næstkommanderende, Navigatør, Sygdomsbehandler, 2 Kommunikationsgaster, 2 Motorpassere, Hovmester, 2 LMG skytter, 3 Dæksgaster og plads til 4 Uddannelsesgaster. SØ divisionen har et højt aktivitetsniveau.
