Flotillens opgaver bliver løst af frivillige medlemmer, der har forskellige forudsætninger med hensyn til kompetencer, alder, aktivitetsniveau og krav til fysiks udfoldelse.
Som medlem er man sammen med 8-15 andre i en besætning eller gruppe, der sammen med 2-4 andre besætninger eller grupper indgår i en division på ca. 30-50 frivillige medlemmer.
Flotillen er organiseret med et Stabselement og to divisioner, som beskrevet herunder:
Stabselementet, består af
flotillechefen, næstkommanderende/planlægningsofficer, 3.kommanderende/uddannelses-støtteofficer og operationsofficeren. Stabselementet har ansvar for daglig ledelse og støtte til flotillen.
- Stabselementets aktivitetniveau varierer fra højt til middel, alt efter funktionen.
Kommando divisionen, sammensat af:
- Divisionstroppen hvor Kommando- og logistikofficeren samt Kommandobefalingsmanden hører hjemme.
- Forsynings- og vedligeholdelsessektionen bestående af Forsyningsbefalingsmand og Næstkommanderende.
- Fartøjssektionen der består af Fartøjsmester og Fartøjsmesterassistent.
- Informations- og uddannelsesstøttesektionen der består af Rekrutteringsofficer, Kontaktofficer, Historiker, Skydelærer, IT-befalingsmand, Webmaster samt Sundheds- og træningsvejleder.
SØ divisionen
- Sejlende besætninger, sammensat af:
Fartøjsfører, Næstkommanderende, Navigatør, Bådsmand, Sygdomsbehandler, 2 Kommunikationsgaster, 2 Motorpassere, Hovmester, 2 Letmaskingeværskytter, 3 Dæksgaster og plads til 4 Uddannelsesgaster.
- SØ divisionen med besætninger, har et højt aktivitetsniveau.